Contenidos
Módulo 3. Alineamiento múltiple y análisis filogenético
Unidad 3.1 Conceptos generales del alineamiento múltiple
Tema 310. Puntuación de alineamientos múltiples
Tema 320. Representación mediante un logo
Unidad 3.2 Métodos de alineamiento múltiple
Tema 350. Métodos progresivos: Feng-Doolittle
Tema 360. Métodos iterativos: Barton-Sternberg
Unidad 3.3 Análisis filogenético
Tema 370. Introducción al análisis filogenético
Unidad 3.4 Métodos de análisis filogenético basados en distancias
Tema 380. Algoritmo de Fitch-Margoliash
Módulo 2. Alineamiento de dos secuencias
Unidad 2.1 Conceptos generales
Tema 150. Tipos de alineamiento
Tema 160. Puntuación de un alineamiento de dos secuencias
Tema 170. Sistemas de penalización de huecos
Tema 180. Matrices de puntuación BLOSUM
Tema 190. Matrices de puntuación PAM
Tema 200. Método gráfico o de la matriz de puntos
Unidad 2.2 Algoritmos de alineamiento global
Tema 210. Algoritmo de Needleman-Wunsch-Sellers
Tema 220. Algoritmo de Needleman-Wunsch generalizado
Tema 230. Algoritmo de Needleman-Wunsch (versión histórica)
Unidad 2.3 Algoritmos de alineamiento local
Tema 250. Algoritmo de Smith-Waterman
Tema 260. Algoritmo de Smith-Waterman (versión histórica)
Unidad 2.4 Alineamiento restringido a una franja
Unidad 2.5 Algoritmos de alineamiento semiglobal
Tema 280. Alineamiento semiglobal
Unidad 2.6 Alineamiento de dos secuencias con Biopython
Tema 290. El módulo Bio.pairwise2
Unidad 2.7 Determinación de la estructura secundaria de una molécula de ARN
Módulo 4. Aplicaciones de la Bioinformática a la Genómica
Unidad 4.1 Búsqueda en bases de datos
Tema 430. Matrices de pesos específicos de posición